Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV50

RFX8, DNA-binding protein RFX8, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX8Q6ZV50 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RFX8Q6ZV50 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RFX8Q6ZV50 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms