Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SRCAPQ6ZRS2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
SRCAPQ6ZRS2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SRCAPQ6ZRS2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms