Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCDC73Q6ZRK6 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCDC73Q6ZRK6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms