Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWZ7

ABRAXAS1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ABRAXAS1Q6UWZ7 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ABRAXAS1Q6UWZ7 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms