Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKG0

LARP1, La-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,096 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LARP1Q6PKG0 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
LARP1Q6PKG0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
LARP1Q6PKG0 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
LARP1Q6PKG0 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms