Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ANKRD54Q6NXT1 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ANKRD54Q6NXT1 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ANKRD54Q6NXT1 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.7 ms