Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUP7

PPP4R4, Serine/threonine-protein phosphatase 4 regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP4R4Q6NUP7 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP4R4Q6NUP7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP4R4Q6NUP7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP4R4Q6NUP7 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP4R4Q6NUP7 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP4R4Q6NUP7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP4R4Q6NUP7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP4R4Q6NUP7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP4R4Q6NUP7 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP4R4Q6NUP7 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP4R4Q6NUP7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP4R4Q6NUP7 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PPP4R4Q6NUP7 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP4R4Q6NUP7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP4R4Q6NUP7 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP4R4Q6NUP7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP4R4Q6NUP7 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP4R4Q6NUP7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP4R4Q6NUP7 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PPP4R4Q6NUP7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
PPP4R4Q6NUP7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms