Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSX1

CCDC70, Coiled-coil domain-containing protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC70Q6NSX1 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC70Q6NSX1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC70Q6NSX1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms