Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ49

SDE2, Protein SDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDE2Q6IQ49 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SDE2Q6IQ49 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SDE2Q6IQ49 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms