Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CENPPQ6IPU0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CENPPQ6IPU0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms