Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPECC1LQ69YQ0 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SPECC1LQ69YQ0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms