Protein–RNA interactions for Protein: Q66PJ3

ARL6IP4, ADP-ribosylation factor-like protein 6-interacting protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL6IP4Q66PJ3 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARL6IP4Q66PJ3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARL6IP4Q66PJ3 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms