Protein–RNA interactions for Protein: Q5U649

C12orf60, Uncharacterized protein C12orf60, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf60Q5U649 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C12orf60Q5U649 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C12orf60Q5U649 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms