Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUP188Q5SRE5 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUP188Q5SRE5 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NUP188Q5SRE5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms