Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL12Q53G59 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLHL12Q53G59 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms