Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY00

TSGA10IP, Testis-specific protein 10-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSGA10IPQ3SY00 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSGA10IPQ3SY00 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSGA10IPQ3SY00 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms