Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAL6

VWC2, Brorin, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWC2Q2TAL6 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
VWC2Q2TAL6 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms