Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CCDC27Q2M243 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CCDC27Q2M243 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms