Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
RPE65Q16518 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
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RPE65Q16518 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
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RPE65Q16518 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
RPE65Q16518 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
RPE65Q16518 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
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