Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CNGA3Q16281 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CNGA3Q16281 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
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