Protein–RNA interactions for Protein: Q15643

TRIP11, Thyroid receptor-interacting protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP11Q15643 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRIP11Q15643 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRIP11Q15643 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
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