Protein–RNA interactions for Protein: Q15637

SF1, Splicing factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 639 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF1Q15637 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF1Q15637 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SF1Q15637 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SF1Q15637 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SF1Q15637 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SF1Q15637 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SF1Q15637 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SF1Q15637 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SF1Q15637 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SF1Q15637 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SF1Q15637 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF1Q15637 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF1Q15637 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF1Q15637 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF1Q15637 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SF1Q15637 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF1Q15637 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF1Q15637 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF1Q15637 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF1Q15637 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF1Q15637 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SF1Q15637 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF1Q15637 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF1Q15637 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF1Q15637 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF1Q15637 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF1Q15637 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF1Q15637 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF1Q15637 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF1Q15637 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SF1Q15637 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SF1Q15637 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SF1Q15637 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SF1Q15637 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SF1Q15637 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SF1Q15637 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SF1Q15637 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF1Q15637 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF1Q15637 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF1Q15637 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF1Q15637 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF1Q15637 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF1Q15637 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SF1Q15637 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF1Q15637 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF1Q15637 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF1Q15637 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
SF1Q15637 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF1Q15637 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF1Q15637 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF1Q15637 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SF1Q15637 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF1Q15637 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF1Q15637 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF1Q15637 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF1Q15637 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF1Q15637 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF1Q15637 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
SF1Q15637 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF1Q15637 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF1Q15637 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SF1Q15637 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF1Q15637 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF1Q15637 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF1Q15637 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF1Q15637 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF1Q15637 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF1Q15637 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF1Q15637 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF1Q15637 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF1Q15637 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SF1Q15637 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF1Q15637 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF1Q15637 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF1Q15637 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF1Q15637 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SF1Q15637 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF1Q15637 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF1Q15637 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF1Q15637 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF1Q15637 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF1Q15637 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF1Q15637 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF1Q15637 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF1Q15637 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF1Q15637 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF1Q15637 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF1Q15637 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF1Q15637 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF1Q15637 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF1Q15637 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF1Q15637 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SF1Q15637 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SF1Q15637 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SF1Q15637 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SF1Q15637 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SF1Q15637 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SF1Q15637 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SF1Q15637 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SF1Q15637 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
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