Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PDK1Q15118 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PDK1Q15118 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms