Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RAB3GAP1Q15042 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB3GAP1Q15042 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
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