Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SMCO1Q147U7 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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