Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SMC1AQ14683 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SMC1AQ14683 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
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