Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IHHQ14623 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IHHQ14623 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IHHQ14623 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IHHQ14623 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IHHQ14623 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IHHQ14623 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IHHQ14623 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
IHHQ14623 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
IHHQ14623 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IHHQ14623 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IHHQ14623 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IHHQ14623 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IHHQ14623 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IHHQ14623 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IHHQ14623 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IHHQ14623 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IHHQ14623 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IHHQ14623 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IHHQ14623 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IHHQ14623 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
IHHQ14623 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IHHQ14623 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
IHHQ14623 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
IHHQ14623 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IHHQ14623 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
IHHQ14623 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
IHHQ14623 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IHHQ14623 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IHHQ14623 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IHHQ14623 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IHHQ14623 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IHHQ14623 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IHHQ14623 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IHHQ14623 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IHHQ14623 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IHHQ14623 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IHHQ14623 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IHHQ14623 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IHHQ14623 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IHHQ14623 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IHHQ14623 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IHHQ14623 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IHHQ14623 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IHHQ14623 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
IHHQ14623 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IHHQ14623 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
IHHQ14623 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IHHQ14623 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IHHQ14623 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IHHQ14623 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IHHQ14623 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IHHQ14623 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IHHQ14623 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IHHQ14623 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IHHQ14623 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
IHHQ14623 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IHHQ14623 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
IHHQ14623 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IHHQ14623 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
IHHQ14623 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IHHQ14623 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IHHQ14623 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IHHQ14623 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IHHQ14623 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IHHQ14623 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
IHHQ14623 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IHHQ14623 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IHHQ14623 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IHHQ14623 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IHHQ14623 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
IHHQ14623 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IHHQ14623 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IHHQ14623 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
IHHQ14623 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms