Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRQ13535 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATRQ13535 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRQ13535 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRQ13535 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRQ13535 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRQ13535 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRQ13535 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRQ13535 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRQ13535 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRQ13535 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRQ13535 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRQ13535 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRQ13535 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
ATRQ13535 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATRQ13535 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATRQ13535 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRQ13535 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ATRQ13535 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ATRQ13535 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRQ13535 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRQ13535 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRQ13535 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRQ13535 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRQ13535 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRQ13535 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRQ13535 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRQ13535 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRQ13535 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRQ13535 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ATRQ13535 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ATRQ13535 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRQ13535 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRQ13535 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRQ13535 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRQ13535 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRQ13535 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRQ13535 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRQ13535 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRQ13535 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRQ13535 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRQ13535 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRQ13535 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRQ13535 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRQ13535 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRQ13535 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRQ13535 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRQ13535 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ATRQ13535 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRQ13535 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRQ13535 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRQ13535 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRQ13535 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRQ13535 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRQ13535 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRQ13535 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRQ13535 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRQ13535 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRQ13535 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRQ13535 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRQ13535 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRQ13535 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRQ13535 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ATRQ13535 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATRQ13535 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATRQ13535 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATRQ13535 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ATRQ13535 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
ATRQ13535 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRQ13535 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRQ13535 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRQ13535 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRQ13535 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRQ13535 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRQ13535 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ATRQ13535 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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