Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PRPF4BQ13523 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PRPF4BQ13523 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms