Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TOP3AQ13472 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TOP3AQ13472 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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