Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CHAF1AQ13111 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CHAF1AQ13111 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CHAF1AQ13111 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
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