Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDH17Q12864 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CDH17Q12864 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CDH17Q12864 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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