Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CNTN1Q12860 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CNTN1Q12860 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
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