Protein–RNA interactions for Protein: Q12208

USB1, U6 snRNA phosphodiesterase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
USB1Q12208 HAP4YKL109W 1665 nt2.69□□□□□ -1.98
USB1Q12208 YDR193WYDR193W 399 nt2.68□□□□□ -1.98
USB1Q12208 YDR340WYDR340W 303 nt2.68□□□□□ -1.98
USB1Q12208 SMT3YDR510W 306 nt2.68□□□□□ -1.98
USB1Q12208 VMA8YEL051W 771 nt2.68□□□□□ -1.98
USB1Q12208 MRPS35YGR165W 1038 nt2.68□□□□□ -1.98
USB1Q12208 DOG2YHR043C 741 nt2.68□□□□□ -1.98
USB1Q12208 SEC65YML105C 822 nt2.68□□□□□ -1.98
USB1Q12208 PNT1YOR266W 1272 nt2.68□□□□□ -1.98
USB1Q12208 UAF30YOR295W 687 nt2.68□□□□□ -1.98
USB1Q12208 RPA43YOR340C 981 nt2.68□□□□□ -1.98
USB1Q12208 PHO88YBR106W 567 nt2.68□□□□□ -1.98
USB1Q12208 YTA7YGR270W 4140 nt2.68□□□□□ -1.98
USB1Q12208 CIN1YOR349W 3045 nt2.67□□□□□ -1.98
USB1Q12208 RAD7YJR052W 1698 nt2.67□□□□□ -1.98
USB1Q12208 POL3YDL102W 3294 nt2.67□□□□□ -1.98
USB1Q12208 BMH2YDR099W 822 nt2.67□□□□□ -1.98
USB1Q12208 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt2.67□□□□□ -1.98
USB1Q12208 DYN2YDR424C 279 nt2.67□□□□□ -1.98
USB1Q12208 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt2.67□□□□□ -1.98
USB1Q12208 PEX21YGR239C 867 nt2.67□□□□□ -1.98
USB1Q12208 YIL089WYIL089W 618 nt2.67□□□□□ -1.98
USB1Q12208 RPC37YKR025W 849 nt2.67□□□□□ -1.98
USB1Q12208 SSN8YNL025C 972 nt2.67□□□□□ -1.98
USB1Q12208 TGL3YMR313C 1929 nt2.67□□□□□ -1.98
USB1Q12208 YPS6YIR039C 1614 nt2.67□□□□□ -1.98
USB1Q12208 PUF6YDR496C 1971 nt2.67□□□□□ -1.98
USB1Q12208 TOM70YNL121C 1854 nt2.67□□□□□ -1.98
USB1Q12208 KTR6YPL053C 1341 nt2.67□□□□□ -1.98
USB1Q12208 VTC4YJL012C 2166 nt2.66□□□□□ -1.98
USB1Q12208 GLG2YJL137C 1143 nt2.66□□□□□ -1.98
USB1Q12208 YKL091CYKL091C 933 nt2.66□□□□□ -1.98
USB1Q12208 YKR011CYKR011C 1062 nt2.66□□□□□ -1.98
USB1Q12208 SPC24YMR117C 642 nt2.66□□□□□ -1.98
USB1Q12208 HHF2YNL030W 312 nt2.66□□□□□ -1.98
USB1Q12208 MRPL37YBR268W 318 nt2.66□□□□□ -1.98
USB1Q12208 MGR3YMR115W 1506 nt2.66□□□□□ -1.98
USB1Q12208 TFB2YPL122C 1542 nt2.66□□□□□ -1.98
USB1Q12208 STE23YLR389C 3084 nt2.66□□□□□ -1.98
USB1Q12208 SOK1YDR006C 2706 nt2.66□□□□□ -1.98
USB1Q12208 HMS1YOR032C 1305 nt2.66□□□□□ -1.98
USB1Q12208 VPS3YDR495C 3036 nt2.66□□□□□ -1.98
USB1Q12208 YPK3YBR028C 1578 nt2.66□□□□□ -1.98
USB1Q12208 BPT1YLL015W 4680 nt2.65□□□□□ -1.98
USB1Q12208 DRS2YAL026C 4068 nt2.65□□□□□ -1.98
USB1Q12208 SPP382YLR424W 2127 nt2.65□□□□□ -1.98
USB1Q12208 DTD1YDL219W 453 nt2.65□□□□□ -1.99
USB1Q12208 SHU2YDR078C 672 nt2.65□□□□□ -1.99
USB1Q12208 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.65□□□□□ -1.99
USB1Q12208 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.65□□□□□ -1.99
USB1Q12208 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.65□□□□□ -1.99
USB1Q12208 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.65□□□□□ -1.99
USB1Q12208 NKP1YDR383C 717 nt2.65□□□□□ -1.99
USB1Q12208 GRX2YDR513W 432 nt2.65□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YOS1YER074W-A 258 nt2.65□□□□□ -1.99
USB1Q12208 APC9YLR102C 798 nt2.65□□□□□ -1.99
USB1Q12208 RNH203YLR154C 333 nt2.65□□□□□ -1.99
USB1Q12208 TAF4YMR005W 1167 nt2.65□□□□□ -1.99
USB1Q12208 SIN3YOL004W 4611 nt2.65□□□□□ -1.99
USB1Q12208 RGC1YPR115W 3252 nt2.64□□□□□ -1.99
USB1Q12208 PAM1YDR251W 2493 nt2.64□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YDL199CYDL199C 2064 nt2.64□□□□□ -1.99
USB1Q12208 PDC2YDR081C 2778 nt2.64□□□□□ -1.99
USB1Q12208 CSR2YPR030W 3366 nt2.64□□□□□ -1.99
USB1Q12208 QCR10YHR001W-A 234 nt2.64□□□□□ -1.99
USB1Q12208 PAN5YHR063C 1140 nt2.64□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YHR180WYHR180W 492 nt2.64□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YLR225CYLR225C 1224 nt2.64□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YLR230WYLR230W 306 nt2.64□□□□□ -1.99
USB1Q12208 MED11YMR112C 396 nt2.64□□□□□ -1.99
USB1Q12208 RIX1YHR197W 2292 nt2.64□□□□□ -1.99
USB1Q12208 TRM1YDR120C 1713 nt2.64□□□□□ -1.99
USB1Q12208 VAS1YGR094W 3315 nt2.64□□□□□ -1.99
USB1Q12208 TAO3YIL129C 7131 nt2.64□□□□□ -1.99
USB1Q12208 EXO84YBR102C 2262 nt2.63□□□□□ -1.99
USB1Q12208 PBI1YPL272C 1554 nt2.63□□□□□ -1.99
USB1Q12208 IRC6YFR043C 714 nt2.63□□□□□ -1.99
USB1Q12208 tQ(UUG)BtQ(UUG)B 72 nt2.63□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YGR219WYGR219W 342 nt2.63□□□□□ -1.99
USB1Q12208 PET54YGR222W 882 nt2.63□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YPT35YHR105W 645 nt2.63□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YJL175WYJL175W 513 nt2.63□□□□□ -1.99
USB1Q12208 AHP1YLR109W 531 nt2.63□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YBL081WYBL081W 1107 nt2.63□□□□□ -1.99
USB1Q12208 SLH1YGR271W 5904 nt2.63□□□□□ -1.99
USB1Q12208 CHS3YBR023C 3498 nt2.63□□□□□ -1.99
USB1Q12208 MTL1YGR023W 1656 nt2.63□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YOR365CYOR365C 2112 nt2.62□□□□□ -1.99
USB1Q12208 MDM1YML104C 3384 nt2.62□□□□□ -1.99
USB1Q12208 MSS4YDR208W 2340 nt2.62□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YHL005CYHL005C 393 nt2.62□□□□□ -1.99
USB1Q12208 RSM26YJR101W 801 nt2.62□□□□□ -1.99
USB1Q12208 PIR1YKL164C 1026 nt2.62□□□□□ -1.99
USB1Q12208 ENV10YLR065C 546 nt2.62□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YBL039W-BYBL039W-B 180 nt2.62□□□□□ -1.99
USB1Q12208 YMR310CYMR310C 954 nt2.62□□□□□ -1.99
USB1Q12208 KRE2YDR483W 1329 nt2.62□□□□□ -1.99
USB1Q12208 COM2YER130C 1332 nt2.62□□□□□ -1.99
USB1Q12208 KAP104YBR017C 2757 nt2.61□□□□□ -1.99
USB1Q12208 ITC1YGL133W 3795 nt2.61□□□□□ -1.99
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