Protein–RNA interactions for Protein: Q08962

NIP7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NIP7Q08962 EBS1YDR206W 2655 nt2.64□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 CTH1YDR151C 978 nt2.64□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 EDC1YGL222C 528 nt2.64□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 CIR1YGR207C 786 nt2.64□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 PET54YGR222W 882 nt2.64□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YIL175WYIL175W 318 nt2.64□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YJL222W-BYJL222W-B 138 nt2.64□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 SDH3YKL141W 597 nt2.64□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YLR012CYLR012C 300 nt2.64□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 RAS1YOR101W 930 nt2.64□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 IAH1YOR126C 717 nt2.64□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 DBP5YOR046C 1449 nt2.64□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 ATP25YMR098C 1839 nt2.63□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YGR237CYGR237C 2358 nt2.63□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YDR340WYDR340W 303 nt2.63□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 MRM2YGL136C 963 nt2.63□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 RPL15AYLR029C 615 nt2.63□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 RPL6AYML073C 531 nt2.63□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 VAM10YOR068C 345 nt2.63□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 RPS7AYOR096W 573 nt2.63□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 JJJ1YNL227C 1773 nt2.63□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 VPS17YOR132W 1656 nt2.63□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 PBI1YPL272C 1554 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 SLI1YGR212W 1407 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 NMD2YHR077C 3270 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 BMH2YDR099W 822 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 PEX10YDR265W 1014 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YDR355CYDR355C 303 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YPT35YHR105W 645 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 THP2YHR167W 786 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 PPX1YHR201C 1194 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 TEM1YML064C 738 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 RPL13BYMR142C 600 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 TRI1YMR233W 681 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YMR310CYMR310C 954 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 RHO5YNL180C 996 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 PFK27YOL136C 1194 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YBR089WYBR089W 600 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 TIM12YBR091C 330 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YPL216WYPL216W 3309 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 SLH1YGR271W 5904 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YIL169CYIL169C 2988 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 EPL1YFL024C 2499 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 RAD5YLR032W 3510 nt2.62□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 MIP6YHR015W 1980 nt2.61□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YME2YMR302C 2553 nt2.61□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 ECM21YBL101C 3354 nt2.61□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 FAA2YER015W 2235 nt2.61□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YDL180WYDL180W 1644 nt2.61□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 SSE2YBR169C 2082 nt2.61□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YDL242WYDL242W 354 nt2.61□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 MRH1YDR033W 963 nt2.61□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 CGR1YGL029W 363 nt2.61□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 USE1YGL098W 738 nt2.61□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 SAY1YGR263C 1275 nt2.61□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 QCR10YHR001W-A 234 nt2.61□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YIR040CYIR040C 333 nt2.61□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YAR075WYAR075W 474 nt2.61□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 NIT3YLR351C 876 nt2.61□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 BLS1YLR408C 369 nt2.61□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 SUR1YPL057C 1149 nt2.61□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 MSM1YGR171C 1728 nt2.61□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 HEH2YDR458C 1992 nt2.61□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 TLC1TLC1 1301 nt2.61□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt2.6□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt2.6□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt2.6□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt2.6□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YDR222WYDR222W 1248 nt2.6□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 RPS23AYGR118W 438 nt2.6□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 RSM26YJR101W 801 nt2.6□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YLR416CYLR416C 399 nt2.6□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 RPS23BYPR132W 438 nt2.6□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 snR34snR34 203 nt2.6□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 ROG1YGL144C 2058 nt2.59□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 BPT1YLL015W 4680 nt2.59□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YGL214WYGL214W 486 nt2.59□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 DAL2YIR029W 1032 nt2.59□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 GCD14YJL125C 1152 nt2.59□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YAL064W-BYAL064W-B 381 nt2.59□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 RPS28BYLR264W 204 nt2.59□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 RIM9YMR063W 720 nt2.59□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 HHF1YBR009C 312 nt2.59□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 HNT3YOR258W 654 nt2.59□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 TCB2YNL087W 3537 nt2.59□□□□□ -1.99
NIP7Q08962 YDL199CYDL199C 2064 nt2.59□□□□□ -2
NIP7Q08962 SCM4YGR049W 564 nt2.58□□□□□ -2
NIP7Q08962 SFH1YLR321C 1281 nt2.58□□□□□ -2
NIP7Q08962 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt2.58□□□□□ -2
NIP7Q08962 RUF5-1RUF5-1 710 nt2.58□□□□□ -2
NIP7Q08962 RUF5-2RUF5-2 710 nt2.58□□□□□ -2
NIP7Q08962 PLM2YDR501W 1566 nt2.57□□□□□ -2
NIP7Q08962 HRD1YOL013C 1656 nt2.57□□□□□ -2
NIP7Q08962 YCR015CYCR015C 954 nt2.57□□□□□ -2
NIP7Q08962 YDR290WYDR290W 330 nt2.57□□□□□ -2
NIP7Q08962 RPL23BYER117W 414 nt2.57□□□□□ -2
NIP7Q08962 SPT2YER161C 1002 nt2.57□□□□□ -2
NIP7Q08962 RPL1BYGL135W 654 nt2.57□□□□□ -2
NIP7Q08962 DLS1YJL065C 504 nt2.57□□□□□ -2
NIP7Q08962 YJR128WYJR128W 360 nt2.57□□□□□ -2
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