Protein–RNA interactions for Protein: Q08211

DHX9, ATP-dependent RNA helicase A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX9Q08211 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DHX9Q08211 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
DHX9Q08211 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.4 ms