Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PRKCDQ05655 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PRKCDQ05655 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms