Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RELAQ04206 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RELAQ04206 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RELAQ04206 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RELAQ04206 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RELAQ04206 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RELAQ04206 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RELAQ04206 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RELAQ04206 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RELAQ04206 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RELAQ04206 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RELAQ04206 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RELAQ04206 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RELAQ04206 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RELAQ04206 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RELAQ04206 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RELAQ04206 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RELAQ04206 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RELAQ04206 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RELAQ04206 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RELAQ04206 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RELAQ04206 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RELAQ04206 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RELAQ04206 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
RELAQ04206 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RELAQ04206 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RELAQ04206 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RELAQ04206 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RELAQ04206 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RELAQ04206 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RELAQ04206 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RELAQ04206 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RELAQ04206 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RELAQ04206 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RELAQ04206 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RELAQ04206 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RELAQ04206 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RELAQ04206 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RELAQ04206 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RELAQ04206 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RELAQ04206 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RELAQ04206 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RELAQ04206 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RELAQ04206 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RELAQ04206 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RELAQ04206 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RELAQ04206 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RELAQ04206 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RELAQ04206 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RELAQ04206 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RELAQ04206 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RELAQ04206 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RELAQ04206 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RELAQ04206 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RELAQ04206 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RELAQ04206 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RELAQ04206 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RELAQ04206 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RELAQ04206 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RELAQ04206 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RELAQ04206 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RELAQ04206 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RELAQ04206 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RELAQ04206 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RELAQ04206 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RELAQ04206 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
RELAQ04206 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RELAQ04206 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
RELAQ04206 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
RELAQ04206 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RELAQ04206 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
RELAQ04206 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RELAQ04206 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
RELAQ04206 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms