Protein–RNA interactions for Protein: Q03591

CFHR1, Complement factor H-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFHR1Q03591 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CFHR1Q03591 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms