Protein–RNA interactions for Protein: Q02556

IRF8, Interferon regulatory factor 8, humanhuman

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF8Q02556 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
IRF8Q02556 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IRF8Q02556 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms