Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DSC2Q02487 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DSC2Q02487 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms