Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CENPEQ02224 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CENPEQ02224 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms