Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDR2Q01850 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDR2Q01850 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms