Protein–RNA interactions for Protein: Q00653

NFKB2, Nuclear factor NF-kappa-B p100 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKB2Q00653 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFKB2Q00653 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFKB2Q00653 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms