Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
ERVFRD-1P60508 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
ERVFRD-1P60508 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms