Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
LOXL3P58215 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
LOXL3P58215 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms