Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
EPHB4P54760 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EPHB4P54760 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EPHB4P54760 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms