Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ATXN1P54253 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ATXN1P54253 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms