Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FOSBP53539 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSBP53539 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSBP53539 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSBP53539 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSBP53539 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSBP53539 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSBP53539 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSBP53539 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSBP53539 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSBP53539 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSBP53539 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSBP53539 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSBP53539 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSBP53539 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSBP53539 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FOSBP53539 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOSBP53539 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOSBP53539 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOSBP53539 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOSBP53539 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOSBP53539 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOSBP53539 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOSBP53539 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOSBP53539 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FOSBP53539 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSBP53539 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSBP53539 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSBP53539 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSBP53539 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSBP53539 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSBP53539 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSBP53539 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSBP53539 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSBP53539 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSBP53539 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSBP53539 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSBP53539 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FOSBP53539 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSBP53539 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSBP53539 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSBP53539 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSBP53539 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSBP53539 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSBP53539 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSBP53539 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSBP53539 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSBP53539 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSBP53539 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSBP53539 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSBP53539 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSBP53539 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSBP53539 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSBP53539 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSBP53539 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSBP53539 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FOSBP53539 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSBP53539 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSBP53539 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSBP53539 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSBP53539 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSBP53539 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSBP53539 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSBP53539 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSBP53539 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSBP53539 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSBP53539 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSBP53539 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSBP53539 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSBP53539 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSBP53539 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSBP53539 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FOSBP53539 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOSBP53539 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOSBP53539 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOSBP53539 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOSBP53539 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOSBP53539 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOSBP53539 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FOSBP53539 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOSBP53539 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOSBP53539 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOSBP53539 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOSBP53539 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FOSBP53539 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOSBP53539 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOSBP53539 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOSBP53539 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOSBP53539 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOSBP53539 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOSBP53539 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOSBP53539 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOSBP53539 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOSBP53539 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FOSBP53539 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
FOSBP53539 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FOSBP53539 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOSBP53539 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOSBP53539 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOSBP53539 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms