Protein–RNA interactions for Protein: P52797

EFNA3, Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA3P52797 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
EFNA3P52797 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC20■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNA3P52797 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms